Preguntas y respuestas acerca del chip 7K

¿Qué ocurrió con la prueba del chip 3K?

El chip 7K fue diseñado para reemplazar el anterior test SNP de 3K. Mide casi 7.000 SNPs, los resultados están antes y tiene un 5% más de confiabilidad respecto de la 3K. También provee un aumento en la confiabilidad de los promedios genéticos de los padres, y lo que es más importante, es de gran importancia en el "descubrimiento de parentescos", significando que si un animal está incorrectamente identificado o NO ha sido identificado, el test podrá decirnos quiénes son el padre y el abuelo materno de ese animal, siempre que ambos toros hallan sido ellos mismos genotipeados.

¿Debería hacerles la prueba de genoma con el chip 7 K a las hembras en mi rodeo?

Para responder esta pregunta apropiadamente, UD primero debe preguntarse a sí mismo qué es lo que hará con los resultados. Si UD los empleará para manejar, seleccionar o inseminar de maneras diferentes a sus animales, entonces debería considerar hacer esta prueba si la información de ella obtenida le ayudará a tomar mejores decisiones y contribuir a crear un buen resultado económico en su hato.

Si UD no puede ver cómo el contar con esta información puede ayudarle a tomar mejores decisiones o puede contribuir a mejorar el resultado económico de su empresa, entonces la inversión no lo vale. Aunque el costo de la prueba de genoma es ahora mucho más accesible ¡no deja de ser una inversión sustancial cuando es multiplicada por muchos animales! Las inversiones deben redituar, deben tener retorno, no sólo es necesario tener en cuenta el costo de la inversión, sino también el costo de oportunidad y el potencial retorno de esos mismos recursos destinados a otras áreas.

¿Cómo puedo evaluar si la prueba de genoma en mis vacas es lo correcto para mí?

La prueba de genoma en sus vacas le ofrece a UD la oportunidad de predecir con más precisión y posicionar genéticamente a sus animales en base a su potencial genético. Posicionar genéticamente a su rodeo puede tener algunas ventajas reales cuando se trata de una serie de decisiones de manejo tales como: 1) Si UD desea usar semen sexado en la porción genéticamente superior de su rodeo, 2) Si UD quiere apartar de su rodeo los animales de menor mérito, y 3) Si UD quiere hacer transplante embrionario trabajando sobre las hembras más destacadas dentro de su rodeo.

¿Cuál es la ganancia en precisión entre animales desconocidos, promedio de los padres, chip 7K y chip 50K? ¿Cómo se compara esta nueva tecnología con la actualmente usada para toros de IA?

Con los animales desconocidos, tenemos que asumir que cada animal es "promedio" con 0% de confiabilidad. Con los promedios de los padres podemos asumir un 38% de confiabilidad y con una prueba con chip 7K generalmente se obtiene un 65% de confiabilidad para un índice como Mérito Neto, TPI o el índice que UD cree para su propio hato. El chip 50K (actualmente usado en los toros de los centros de IA) tiene una confiabilidad aproximada de 72% para tales índices.

¿Qué es lo que significa esa ganancia para el progreso genético en mi rodeo?

La mayoría de las lecherías inseminan a todas las hembras en situación de preñarse para lograr la reposición. Si esta es su práctica y planea continuar en ella, entonces la prueba de genoma no tendrá ningún valor para su rodeo. Si UD planea usar los resultados de la prueba de genoma para enfocarse en generar reemplazos a partir de los animales genéticamente superiores de su rodeo, entonces la prueba de genoma puede tener un impacto positivo en algunas situaciones, especialmente si UD tiene actualmente identificación faltante o poca precisión en la identificación.

¿Qué aspecto tendrán los resultados genómicos si decido hacerles el test a mis animales?

Los resultados se verán como la "prueba" de un toro. Los animales obtendrán estimaciones para rasgos como Leche (PTAM), Grasa (PTAF), Proteína (PTAP), Vida Productiva, Tasa de Preñez de las Hijas, Conteo de Células Somáticas, Tipo, Compuesto de Ubre, Compuesto de Patas y todos los rasgos de la prueba lineal. Si UD hace el test a un grupo de animales, puede colocar los resultados en una planilla y ordenarlos por índices tales como TPI o Mérito Neto, una práctica comúnmente hecha con las evaluaciones de los toros.

¿Puedo hacer un ranking con mis animales en base a su potencial genético sin hacerles la prueba de genoma?

¡SI! Aunque no es frecuentemente considerado, un rodeo comercial que posee una identificación completa y precisa de sus animales, puede crear un ranking interno de potencial genético de los animales basado en el promedio de los padres de cada animal, y esto con una considerable confiabilidad (aproximadamente 38%). De hecho, se puede calcular el promedio de los padres para cada rasgo de la prueba de un toro, y tendrá un aspecto muy similar a los resultados de una prueba genómica aunque con menor nivel de confiabilidad. Esto es muy importante, porque para un rodeo con identificación completa y precisa de padres y abuelos maternos, la decisión de hacer test de genoma a las vaquillas o no, es en el fondo, una decisión de la confiabilidad de un ranking interno elaborado en base a los promedios de los padres versus la confiabilidad de este ranking elaborado en base al test de genoma de cada animal.

¿Qué es el Promedio de los padres?

El Promedio de los Padres es la genética promedio entre el padre y la madre de un animal. Frecuentemente, se estima empleando la información del Padre y del Abuelo Materno del animal cuando no hay disponible información de desempeño de la madre.

Llevo registros de Padre x Abuelo Materno ¿es confiable mi promedio de los padres?

Eso depende de la confiabilidad de su sistema de identificación. Si UD está haciendo un buen trabajo en el registro de inseminaciones, e identificando las becerras, haciendo que tanto el padre como el abuelo materno estén correctamente identificados, entonces el promedio de los padres de su rodeo tendrá suficiente confiabilidad como para permitirle a UD elaborar un ranking interno de sus animales para propósitos básicos.

¿Quién puede hacer el trabajo de calcular los promedios de los padres o elaborar un ranking de animales por índice?

UD debería trabajar en esto con su asesor en genética de confianza, generalmente su compañía proveedora de genética. Es muy importante recordar que antes de hacer un ranking de sus animales ¡primero UD debe determinar en función de qué los está clasificando! Esto significa que UD antes debe haber desarrollado un plan genético de modo de poder enfocarse en los rasgos que le son importantes.

¿Qué ocurre si no tengo una identificación precisa o completa de mi rodeo?

Sin una identificación completa y precisa, el ranking de animales basado en el Promedio de los Padres se hace una tarea mucho más difícil, probablemente, imposible. Muchas veces la precisión de la identificación intra rodeo se sobreestima, tengamos en cuenta que la tasa de error promedio en la identificación de animales es del 25%. Si lo que está en cuestionamiento es la precisión de su identificación, entonces el test de genoma le provee de una buena oportunidad para determinar la precisión real de su identificación, además de un ranking preciso de sus animales.

Si yo tengo una identificación completa y precisa de los animales de mi rodeo ¿en qué situaciones tiene sentido para mí hacer la prueba de genoma a mis animales?

La respuesta depende, nuevamente, de lo que UD hará con dicha información. Si UD simplemente la usará para ver como quedan posicionados sus animales genéticamente comparados con otras lecherías, claramente esto no le reportará ningún beneficio. Si UD lo usa para rechazar la porción inferior de animales, tampoco es probable que le reditúe ya que eso mismo puede hacerse con el simple cálculo de los promedios de los padres. Sin embargo, so UD quiere seleccionar los animales más extremos para hacer trabajos de transplante embrionario, será una buena estrategia primero hacerle el genoma a un grupo de vientres preseleccionados para asegurarse de que sólo las mejores hembras vayan a lavaje.

Estoy sorprendido de leer que el uso de esta tecnología para rechazar a los animales inferiores o asignar los mejores para inseminar con sexado no sea redituable

En algunas situaciones extremas, puede que sí sea redituable, pero si su rodeo tiene un desempeño dentro de lo esperado y UD posee un sistema de identificación completo y preciso, entonces las vaquillas vírgenes tendrán un promedio de sus padres con una confiabilidad rondando el 40% para índices como Mérito Neto o TPI. Esa confiabilidad aumentará a aproximadamente 60% con el test de genoma. Usando las estadísticas, podemos asumir que la probabilidad de que un animal incremente en más de 100 puntos su Mérito Neto o en más de 150 puntos su TPI es de sólo el 11%, y de manera similar, la probabilidad de que un animal cambie en al menos 200 puntos de Mérito neto o 300 puntos de TPI es de sólo un 1%.

Si el 15% de mis animales aumentará en 100 puntos de Mérito Neto o 150 puntos de TPI, y otro 15% de mis animales caerá en las mismas cantidades ¿no representa esto una considerable diferencia en el ranking de mis animales?

Hará una substancial diferencia en el ranking de unos pocos animales, pero la mayor parte de los hatos trabaja con grupos de animales. Por ejemplo, el grupo más alto genéticamente podría ser destinado a inseminación con semen sexado, mientras que los animales más pobres en términos de genética podrían ser rechazados del rodeo. Cuando nos manejamos con grupos, necesitamos considerar qué tanto cambiará el promedio del grupo si para clasificarlas hacemos la prueba de genoma a las vaquillas versus si sólo calculamos el promedio de sus padres. Si su rodeo es normal, cerca del 95% de sus animales estarán dentro de un rango de +/- 400 Mérito Neto y el promedio en sus vaquillas vírgenes estaría en 100 MN. Si UD quisiera seleccionar el 25% mejor de sus hembras para inseminar con semen sexado, el grupo de vaquillas seleccionadas probablemente sería el de más de 250 MN. El 10% inferior (que sería rechazado) tendría menos de 150 MN.

En esta situación ¿cuál es la probabilidad de que una vaquillona seleccionada para ser inseminada con semen sexado basados en su promedio de los padres (en el 25% mejor) pudiera caer en el grupo a rechazar (en el 10% peor) luego de hacerle la prueba de genoma?

Volviendo atrás a la pregunta anterior, sólo hay un 1% de posibilidades de que un animal cambie en 200 puntos de Mérito Neto, de modo que la probabilidad de que un animal candidato a ser inseminado con semen sexado pase a ser candidato a ser rechazado del rodeo (o viceversa) es casi cero, ya que para que ello ocurriera, debería cambiar en al menos 400 puntos de Mérito Neto.

Figura 1: El gráfico representa una situación de rodeo en el cual el 25% superior de los animales basados en el promedio de sus padres estarían siendo seleccionado para ser inseminado con semen sexado y el 10% inferior sería vendido. En una situación normal hay casi 0% de chances de que un animal seleccionado para rechazo basado en el promedio de sus padres termine en el 25% superior inseminado con semen sexado una vez que se cuenta con su prueba de genoma.

Pero un animal todavía podría cambiar significativamente y por consiguiente, el grupo a rechazar del rodeo o a inseminar con semen sexado podría cambiar antes y después de hacerles la prueba de genoma.

Esto es absolutamente cierto, ya que la precisión de la selección en el grupo aumenta. Sin embargo, necesitamos preguntarnos cuál será el efecto de este cambio. En un rodeo con distribución normal, hay menos del 2% de posibilidades de que un animal de la mitad superior por promedio de los padres termine en la mitad inferior una vez que se le hace la prueba de genoma. Por eso, los animales que cruzan el umbral, y cambian de grupo pasando a ser rechazados (o a ser inseminados con semen sexado) no cambian significativamente el promedio del grupo.

¿Cuál es el "riesgo" de "error" en la evaluación 7K?

No hay demasiado "riesgo" en la evaluación 7K. Siempre le proporcionará a UD información más confiable que el cálculo de un promedio de los padres (o que no tener ninguna información). El riesgo real es el costo de oportunidad de invertir miles de dólares cuando esos dólares podrían tener mejores retornos si se invirtiesen en otras áreas de la lechería. Generalmente, el simple hecho de usar esos dólares para comprar genética de mayor calidad debería ser considerado como la primera alternativa de inversión.

Si me estoy expandiendo con mi rodeo, o necesito comprar hembras de reposición ¿debería yo comprar sólo vaquillas con prueba genómica 7K hecha?

Esta es una pregunta interesante, y en algunas situaciones puede tener sentido pagar para hacerle la prueba a vaquillas desconocidas. En una situación normal, UD necesitaría hacerle la prueba a al menos el doble de las vaquillas que planea comprar para hacer de esto una decisión financieramente justificable. Esta decisión será determinada por la relación entre costo de reposición versus el precio del Kg. carne. En los niveles actuales de bajo costo de reposición, hacerle una prueba de genoma a animales desconocidos no será posiblemente una inversión con retorno, sin embargo, si UD en alguna situación atravesara altos costos de reposición, como ha sido el caso en el pasado, sí tendría sentido hacerlo.

Si elijo hacerles prueba de genoma a animales de identidad desconocida ¿cuáles serían los beneficios?

Hay 2 beneficios principales: 1) "Descubrimiento del padre": Esto significa que tendremos la posibilidad de determinar cuál es el padre del animal testeado (esto si se trató de un toro de IA); 2) "El Descubrimiento del Padre" es el primer paso en la determinación de una estimación genómica precisa. Lo que UD recibirá es una prueba genómica, al igual que los otros animales, o una prueba de toro, como se la describió antes.

¿Puedo dejar de llevar registros de producción y clasificación con la prueba genómica 7K?

Generalmente se llevan registros de producción por motivos de manejo, y no por motivos genéticos. Debemos recordar que aunque la prueba de genoma nos proporciona muchísima información de valor acerca de la genética de un animal, el potencial genético por sí solo no responde a nuestras muchas preguntas de manejo. Por ejemplo, un animal con alto recuento de células somáticas hoy puede necesitar tratamiento o bien ser rechazado, y la información genómica de este animal no nos brindará información para tomar esa decisión.

También es importante que continuemos reuniendo información fenotípica (a través de registros de lactancias y clasificaciones) de modo que nuestras estimaciones genómicas continúen siendo actuales, relevantes y precisas para una rentabilidad de la lechería que se halla en constante cambio.

¿Cuál es la conclusión final de todo esto?

La genómica es una excelente tecnología y ciertamente genera entusiasmo. Sin embargo, hay que ejercitar la precaución cuando se decide si es la inversión correcta para UD. Al igual que con cualquier otra nueva herramienta, o información, recuerde preguntarse a sí mismo cómo usará esa información y cómo se pagará la inversión. Si UD puede responderse esas preguntas y para UD es una decisión redituable, entonces es lo correcto para UD. Si esas preguntas sólo dan lugar a más preguntas, entonces proceda con precaución.

Artículo escrito por Nate Zwald, Senior Director Global Strategy and Marketing